أما الأمين العام فيعيّنه مجلس ادارة الجمعية بأكثرية ثمانية أعضاء على الأقل، ثم يعرض المجلس هذا التعيين على أول جمعية عمومية بقصد تثبيته. وفي حال رفض التثبيت، يُعتبر قرار تعيين الأمين العام لاغياً.

يرأس الأمين العام الجهاز الفني والإداري للجمعية، كما يرشّح الموظفين والخبراء الذين يحتاجهم لسير العمل، ويقدّم تقارير دورية الى مجلس الإدارة ويحضّر مشروع الميزانيّة السنوية وتقرير الحسابات الختاميّة. كذلك يشارك الأمين العام في اجتماعات جميع اللجان الاستشارية، كما يقدّم المؤازرة لجميع اعضاء الجمعية في علاقاتهم المهنية فيما بينهم ومع جمعية المصارف ومصرف لبنان والمؤسسات الحكومية.

تضمّ هيكليـة الأمانــة العامــة 4 مديريــات هــي :

• المديريــة الاداريــة والماليـــة
• مديريــة الدراســات والإحصــاء
• مديرية تطوير الموارد البشرية
• مديرية الإعـلام والعلاقــات العامـة